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　　維吾爾族祖先，公元前５世紀前就游牧、農耕于中國北方和西北貝加爾湖以南、額爾齊斯河和巴爾喀什湖之間、天山南北及塔里木河流域，經常遭受自然災害的威脅。因此，早已懂得利用一些自然因素來處理簡單的疾病。如用粘土、蒜汁和草香涂于肢體來預防害蟲，用溫泉浴、披獸皮和灼熱的細沙埋肢體來解除關節疼痛，用放血減輕沙漠干熱性頭痛。

　　古代維族祖先的醫藥學基本理論早已在公元前４世紀前形成，認為整個自然以至整個宇宙的基礎是由火、氣、水、土四要素的矛盾和組合而構成；而人的生命是由自然界中四要素的組合才得以形成，同時也是在其經常的、直接的影響下才能得以維持的。這一唯物的自然觀，后來被古希臘醫生希波克拉底所接受，成了他整個醫學觀點的基礎。古希臘醫學著作被譯成阿拉伯語以后，其四要素學說就正式成為以后時期的阿拉伯醫學、中亞醫藥學的基礎理論。西漢張騫出使西域，帶回了許多西域藥材，其中包括胡桃、胡蒜、胡豆、石榴、紅花、葡萄等。中原最早的藥物學專著《神農本草》就收載葡萄、胡麻、硫磺、鹿、羊角等西域藥材。從《神農本草》到唐代《新修本草》共載８５０種藥，其中首次增添的１１４種藥物多數是從西域引進的。　　

　　公元８世紀，唐天寶年間，于闐古代維吾爾名醫比吉·贊巴·希拉汗應聘入西藏，擔任王室侍醫，曾將自己所著十余種醫書譯成藏文獻給藏王。藏王赤德祖贊（７０４—７５４年在位）令人將書集中收藏，統一命名為《王室養生保健全書》。希拉汗曾與他人合寫３０多部醫藥著作，他告老返回于闐前曾將有關人體解剖測量的書籍和包括諸論治療、切脈秘訣等內容的醫學巨著《黃色比吉經函》一起獻給藏王。這些維醫藥著作對后來的藏醫名著《四部醫典》的產生起了很大作用。　　

　　公元９世紀左右的《回鶻醫學文獻》是反映當時高昌（今吐魯番）回鶻王朝醫學的珍貴資料，其內容包括臨床各科疾病、治療及藥方。隋唐時代，古代維吾爾醫藥曾經興盛一時。揚州是當時商業城市，西域的僧侶、商人絡繹不絕地來到揚州。揚州高僧鑒真和尚為到日本去傳教，因幾次渡海失敗，患眼疾失明，后來請到一位西域回鶻醫生給他做了手術后痊愈。由此可見，當時維醫已有相當高的外科手術技術。維吾爾著名科學家、哲學家、天文學家、醫學家法拉比（公元８７０—９５０年）有醫學著作十幾部，他以四大物質（四要素）學說論證了自然界和人體生理、病理的變化關系。這不但對推動回鶻醫學發展起了重要作用，甚至對阿拉伯醫學、中亞醫學產生了巨大影響。　　

　　１０世紀新疆處于喀拉汗王朝時期，維族開始信奉伊斯蘭教，為此新疆阿圖什設立了“麥德日斯·薩其也”（放光）學堂，它是包括醫學專科在內的綜合性科學院校。該校最著名的維醫外科學家伊麻都丁·喀什格日是受人民尊敬的醫師，他多次奔赴戰場成功地完成了各種外科手術。

　　１２世紀初，西遼政權統治新疆至蒙古時期，和田一位著名的維醫學家阿老丁·穆罕木德·和田尼（１１５０—１２２２年）著有治療精華及法醫手抄本一直流傳至今。同一時期，維吾爾醫名醫賈馬力丁·阿克薩依的維醫專著《阿克薩依》于１８９９年在印度勒克瑙城正式出版，該書是一部國內外享有很高聲譽的維醫藥名著。　　

　　據庫車１７世紀維吾爾名醫《西日甫·本·佳馬力丁·阿吉傳》記載：庫車著名維醫學家胡都優木汗·阿吉（１５６７—１６５８）１６１９年參與《回回藥方》３６卷編撰工作。　　

　　明清時期，維醫藥學知識在漢族中醫藥著作中有了更多的反映。近代，喀什、和田、吐魯番地區有過不少有名望的維醫藥學家，對維醫的延續和發展作出了卓越的貢獻。　　

　　維醫藥學在經歷了２５００多年的漫長積累后，形成了完整的、獨具特色的醫藥理論體系，為東西方醫藥學的形成發展作出了重大貢獻。